Matej Pregelj je znanstveni sodelavec na IJS in docent fizike na FMF UL. Na IJS vodi področje za nevtronsko sipanje v Laboratoriju za meritve v velikih raziskovalnih centrih. S široko zbirko odmevnih publikacij in več pridobljenimi raziskovalnimi projekti prispeva pomembne dosežke na tem področju.
Njegova glavna raziskovalna področja vključujejo nizko-dimenzionalne in frustrirane kvantne spinske sisteme, večplastne magnetne filme in anorganske nanostrukture. Uporablja vrsto komplementarnih eksperimentalnih tehnik, vključno z elastičnim in neelastičnim nevtronskim sipanjem, elektronsko spin resonanco, jedrsko magnetno resonanco in muonsko spektroskopijo, kar omogoča celovito razumevanje temeljne fizike.