Matjaž Žitnik je znanstveni svetnik na IJS in profesor na FMF UL, kjer poučuje atomsko fiziko. Na IJS vodi program za Raziskave atomov, molekul in struktur s fotoni in delci na Odseku za fiziko nizkih in srednjih energij.
Njegovo glavno raziskovalno področje sta elektronska in fotonska (koincidenčna) spektroskopija za preučevanje redke snovi (plin atomov in molekul ter skupki) pri vzbujanju s svetlobo majhne (sinhrotron) ali velike jakosti (laser, laser na proste elektrone). Pri tem gre za iskanje in vrednotenje novih (večdelčnih) procesov pri vbujanju in razpadu kvantnih stanj, za kvantno interferenco razpadnih poti, za skupinsko dinamiko teh procesov ter za povratni vpliv snovi na emisijo svetlobe, predvsem pri kratkih valovnih dolžinah.